Цистит относится к полиэтиологическому заболеванию. Возбудителями цистита обычно являются кишечная палочка, стафилококк, протей, стрептококк. Помимо бактериальных возбудителей в этиологии цистита играют роль микоплазмы, вирусы, хламидии, трихомонады, грибы.
Микроорганизмы могут проникать в мочевой пузырь различными путями: восходящим - из мочеиспускательного канала, нисходящим - из почки, лимфогенным - из соседних тазовых органов, гематогенным - из отдаленных очагов, непосредственным (прямым).